Dany Dumont / gotm_ismer

09 Sep, 2014

1 commit

84ed20a5 Construction d'un nouveau modele biogeochimique bio_gsj, base sur bio_ismer, com… ... Browse Dir »

…prenant une classe hydrocarbure et une deuxieme classe de bacteries pouvant degrader les hydrocarbures. Le traceur hydrocarbon (hcb) est calque sur le traceur nitrate auquel on a ajoute la possibilite de specifier, via la namelist bio_gsj, une vitesse vertical (settling or rising). Trois fichers namelist sont affectes par ce changement (bio, obs et bio_gsj).

2014-09-09 11:37:02 -0400

08 Sep, 2014

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8d24f9ca Correction de plusieurs erreurs dans les termes impliquant les preferences de br… ... Browse Dir »
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…outage par les dexu classes de zooplancton (z1 et z2).
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Dany Dumont
2014-09-08 13:41:05 -0400

15 May, 2014

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580c08ac Correction d'un bog avec les termes lies a la mte (mte=.true.) dans les equation… ... Browse Dir »
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…s de reaction. Le probleme faisait en sorte que le modele n'etait pas conservatif.
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dumoda01
2014-05-15 20:08:52 +0000

06 May, 2014

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bb20eea6 Resolution d'un bogue dans bio_ismer.F90 ou des variables declarees deux fois creaient des NaN. Browse Dir »

dumoda01
2014-05-06 20:58:53 +0000
b7e38dff Ajout d'un terme de broutage du p1 par le z1 avec sa preference r14 correspondan… ... Browse Dir »
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…te. Ajout de amratio et hmratio comme parametres de la namelist bio_ismer.nml.
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dumoda01
2014-05-06 15:53:48 +0000

05 Jun, 2013

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4aaa729a Le dependance en temperature du modele bio_ismer est maintenant activable via un… ... Browse Dir »

…e variable logique (mte) dans la namelist bio_ismer.nml. Quatre nouveaux coefficients peuvent egalement etre modifies dans la namelist (ca1, ca2, ch1, ch2). Une description de ces parametres a ete integree dans nml/bio_ismer.nml.

2013-06-05 15:29:15 +0000

30 May, 2013

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4e171ca6 Modification du modele bio_ismer par l'ajout de diagnostics (lumlim2, etc.) et l… ... Browse Dir »
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…'ajout de coefficients au module de dependence en temperature.
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dumoda01
2013-05-30 16:00:05 +0000

06 May, 2013

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5f398854 Le modele bio_ismer contient desormais une dependence explicite des flux biologi… ... Browse Dir »

…ques en fonction de la temperature, basee sur la Metabolic Theory of Ecology (MTE) exposee dans Gillooly et al. (2002). Certains parametres restent a ajuster et ce modele n'a pas encore ete teste. Utilisez avec precaution. Pour desactiver cette option, il faut le faire dans le code en fixant les variables amr1, amr2, hmr1 et hmr2 a 1.0.

2013-05-06 15:00:54 +0000

15 Mar, 2013

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dd570312 Ecriture de la valeur des parametres biologiques de bio_ismer dans $out_ismer.par. Browse Dir »

dumoda01
2013-03-15 18:58:13 +0000

12 Mar, 2013

1 commit

afaf47ce bogue mineur a resoudre plus tard Browse Dir »

dumoda01
2013-03-12 12:51:28 +0000

01 Mar, 2013

1 commit

64abe2ca Correction d'une erreur de l'indice j de cc(j,i) specifiant les nitrate dans le modele fasham. Browse Dir »

dumoda01
2013-03-01 18:46:51 +0000

28 Feb, 2013

3 commits

b19e2b84 Distinction entre les taux de mortalite des differentes classes d'heterotrophes et d'autotrophes. Browse Dir »

dumoda01
2013-02-28 21:14:17 +0000
b0a803da Complement de modification a la revision precedente sur l'harmonisation de la pr… ... Browse Dir »
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…ise en charge du nitrate et de l'ammonium par le module bio.
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dumoda01
2013-02-28 21:10:24 +0000

8473db4a Les routines nitrate.F90 et ammonium.F90 ont ete transportees de /meanflow a ext… ... Browse Dir »

…ras/bio afin de simplifier la prise en compte des dependences (voir Makefile respectifs). Il n'est donc plus necessaire de modifier le code avant de changer de modele biologique.

2013-02-28 20:09:26 +0000

26 Feb, 2013

2 commits

ac88286b Ajout de broutage du mesozoo sur le microzoo (preference r24). Browse Dir »

dumoda01
2013-02-26 14:32:42 +0000

8ea84af1 Correction d'un bogue dans bio.F90 pour que le code fonctionne avec bio_ismer.F9… ... Browse Dir »

…0. Pour changer de modele biologique, il faut modifier l'indice des traceurs nit et amm dans bio.F90 et meanflow/nitrate.F90 et meanflow/ammonium.F90. Ceci devra etre regularise eventuellement.

2013-02-26 03:54:56 +0000

22 Feb, 2013

2 commits

e74c0f0a Ajout d'une routine et d'un fichier namelist pour le nouveau modele biologique b… ... Browse Dir »

…io_ismer. Celui-ci est une version modifiee de Fasham auquel on a ajoute une classe de phyto et une classe de zoo supplementaires. Un terme de nitrification a ete ajoute. Les parametres par defaut devront etre ajustes.

2013-02-22 02:52:20 +0000

55e3f794 Incorporation d'un nouveau modele biologique (bio_ismer). La routine principale … ... Browse Dir »
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…ainsi que la namelist associee seront deposees dans la prochaine revision.
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dumoda01
2013-02-22 02:49:59 +0000

19 Feb, 2013

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524b0746 Les parametres n_initial et a_initial ont ete retires du code et de la namelist associee. Browse Dir »

dumoda01
2013-02-19 16:25:16 +0000

09 Feb, 2012

2 commits

18bfc708 Les changements de la revision precedente, qui permettent d'uniformiser le trait… ... Browse Dir »
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…ement de la lumiere entre les modules physique et biologique, ont ete appliques a tous les modeles biologiques et leurs namelists respectives.
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dumoda01
2012-02-09 19:55:55 +0000

aee6c9dc Le code a ete modifie pour permettre au modele biologique de Fasham d'utiliser l… ... Browse Dir »

…es memes valeurs d'extinction que celle utilisees dans la partie physique, notamment par le module temperature. Le parametre 'A' du module physique a ete remplace par 'aa' pour etre consistant avec le module biologique. Ce changement permet notamment de fournir les valeurs de A, g1 et g2 via un fichier et que ces valeurs soient egalement prise en compte par le module bio. Il reste a appliquer ces changements aux autres modeles biologiques.

2012-02-09 19:38:49 +0000